Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18532 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18532 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18532 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms