Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms