Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Parva-201ENSMUST00000033030 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sptan1P16546 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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