Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P10404 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P10404 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P10404 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P10404 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P10404 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms