Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb6P09023 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxb6P09023 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms