Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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H2-Eb1P04230 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Eb1P04230 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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