Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01649 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01649 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P01649 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01649 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01649 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P01649 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P01649 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms