Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CcnkO88874 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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