Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfdp1O88271 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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