Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp4O70480 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp4O70480 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp4O70480 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp4O70480 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms