Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BckdkO55028 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BckdkO55028 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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