Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Zmat3O54836 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zmat3O54836 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Zmat3O54836 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Zmat3O54836 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Zmat3O54836 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Zmat3O54836 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zmat3O54836 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms