Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clk2O35491 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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