Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alx4O35137 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms