Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec22bO08547 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms