Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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