Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2056J3QQ02 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms