Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Smim18J3QNP2 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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