Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms