Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28048F7BCN0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28048F7BCN0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Gm28048F7BCN0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm28048F7BCN0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm28048F7BCN0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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