Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Taf4E9QAP7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Taf4E9QAP7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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