Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm3020E9Q3J7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm3020E9Q3J7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms