Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm9972E9Q053 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms