Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx60E9PZQ1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx60E9PZQ1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms