Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brd1E9PZ26 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Brd1E9PZ26 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms