Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm6904E9PVF1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6904E9PVF1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms