Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc175E9PVB3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms