Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh8D3Z6W3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms