Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms