Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms