Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phf11bB4XVQ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms