Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprbB2RU80 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PtprbB2RU80 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PtprbB2RU80 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PtprbB2RU80 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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PtprbB2RU80 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PtprbB2RU80 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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