Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lcn6A2AJB9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lcn6A2AJB9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lcn6A2AJB9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lcn6A2AJB9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Lcn6A2AJB9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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