Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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PtprfA2A8L5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprfA2A8L5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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