Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vstm4T1NXB5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vstm4T1NXB5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vstm4T1NXB5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.3 ms