Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vamp5Q9Z2P8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vamp5Q9Z2P8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms