Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn8Q9Z260 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms