Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ap3b1Q9Z1T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ap3b1Q9Z1T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms