Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms