Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr4Q9Z1L2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syngr4Q9Z1L2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syngr4Q9Z1L2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngr4Q9Z1L2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms