Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nek4Q9Z1J2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms