Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf394Q9Z1D9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms