Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog1Q9Z160 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms