Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pard6aQ9Z101 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard6aQ9Z101 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms