Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stxbp4Q9WV89 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stxbp4Q9WV89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms