Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax2Q9WTP9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax2Q9WTP9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms