Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam50bQ9WTJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam50bQ9WTJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms