Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zeb2Q9R0G7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zeb2Q9R0G7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zeb2Q9R0G7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms