Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod1Q9R0E2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod1Q9R0E2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod1Q9R0E2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms