Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf346Q9R0B7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf346Q9R0B7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms